一、实验室选址
根据2004年4月关于疾病预防控制中心基本设施建设标准的讨论稿的精神，疾病预防控制中心的房屋建设，包括业务用房、实验用房、行政用房、保障用房和公共配套设施用房等部分。而其他公共配套设施，系指采暖热源、洗衣房、固体废弃物处置、废弃放射源存放、托幼院、职工食堂等，应该尽量一拖社会化服务来解决。
疾病预防控制中心的选址应符合当地城市的总体规划和布局要求，并宜符合下列要求：
- 利用城市基础设施；
- 地形比较规整、交通方便；
- 不宜与市场、学校、幼儿园、公共娱乐场所毗邻；
- 应该避开化学、生物、噪声、振动、强电磁场等污染源及易燃易爆场所；
- 此外，总平面布置应充分利用地形地貌，科学布置各类建筑，正确处理功能分区之间的相互关系，合理组织人流、物流。
目前很多地方的CDC由于历史缘故，建设在人口比较密集的地方，或原来建在离市区较远的地方，但随着城市化规模的扩大，也逐渐融人其中。因此在新的建设中选址方案一定要请相关部门进行分析、比较，还要根据城市的整体发展规划，并结合危急状况下的应急预案，找出最佳选址位置。
二、实验室布局
1、应该根据CDC日常工作的特点，如实验项目范围较广、需要应付突发事件、今后发展功能扩展的需要等原则进行规划和设计。
按照相关规范和要求，实验区域和办公区域一定要分区。如为了节省占地面积，需将办公和实验都建在一幢楼中时，必须做好分区划分。分区一般有两种形式：一种是按照平面分，也就是按楼层分，即将办公区域设在较低的楼层，实验区域布置在上面的层次。但这样的布置要注意几个问题：虽然在最底层布置了办公区域，但必须留有一定的区域留作收样和发实验报告用。另一种就是垂直，即以建筑物中部楼梯作为分界线，楼梯的一侧可作为实验区域，另一侧作为办公区域，中间用门将两个区域分开。如果是两边设楼梯的形式，那这两个区域可以完全分开。
物流和人流的路径应分开，特别是有净化要求的区域和有较严重污染物产出的区域。同时将物流分为干净和污染物分别走的通道，可以避免交叉污染。一般高于三层的建筑物，建议设置电梯比较好。
2、A+B模式
目前CDC的实验室布局通常按照科室的编制进行配置，每个科室的实验室配置都相对完善，这样的布局可以使一个科室所辖的实验项目均可在本科室的实验室独立完成。从实际使用效果来看，这种模式的布局在规模比较小的CDC中较合适，因其科室配置较少，需要检测的项目很多，但对于省、市等的大型的CDC建设就有其不足，如果按照科室设置进行实验室的布局，可能会存在以下的不妥：造成实际使用面积和工程费用的增加。对于一些有相同或类同使用功能的实验室，如果各个科室都设置，必然使需要的面积增加较多。特别是一些有净化要求的实验室，除了主实验室外，还需要有辅助的实验房间与之配套，多个独立的主实验室就要浪费比较多的辅助实验空间。此外，这些房间对环境要求较高，需要空调系统进行维持，如果都是在各个科室(区域)进行独立设置，就需要设多个空调机房和较长的风管，造成工程费用的增加。
实验仪器增加，资源配置不合理。实验室数量的增加，配置的实验仪器也要增加，人员的编制也有可能增加。同时由于各个科室的实验任务不一定每时每刻都是满负荷的，可能会造成部分仪器的闲置率增加，造成资源的浪费。不利于管理和教学:一些有净化要求的房间和有负压要求的实验室，其实验环境对实验的的过程和结果都有较大的影响，如果这些实验室都分到各个科室分散管理，没有集中管理的好。特别是一些兼有培训任务的CDC，如果没有一定的教学实验室，而直接将教学在作实验的实验室进行，对实验数据会造成一定的影响。
